S+SpatialStats (Já incluso no S+ standard)
O único "pacote" estatístico de abrangente espectro projetado para análise espacial de dados espacialmente correlatos (spatial correlated data)

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S+Wavelets (Já incluso no S+ standard)
Um ferramental para análises Wavelets atendendo a uma ampla gama de problemas envolvendo sinais, imagens e séries temporais.

Transformadas Wavelets discretas
Ampla gama de funções básicas Wavelets
Decomposição e análise com multi-resolução
Displays gráficos Tempo-Frequencia
Estimadores de variância-covariância Wavelets
Fractionally Differenced (FD) Process parameter estimators
Hidden Markov Tree Modeling

Veja relação de features Wavelets completa em: http://www.insightful.com/products/wavelets/features.asp

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EnvironmentalStats for S-PLUS (Já incluso no S+ standard)
EnvironmentalStats para S-PLUS é um módulo especializado, em adição ao S-PLUS, que fornece um poderoso, ainda que simples de usar, conjunto de menus e funções para análises estatísticas e gráficas de dados ambientais. O software traz os principais métodos encontrados atualmente em documentos regulatórios e na literatura sobre o assunto em um “pacote” estatístico, juntamente com um extenso “help” com recursos de hipertexto que explica o que esses métodos fazem, como usá-los e onde encontrá-los na literatura sobre estatística ambiental disponível atualmente. Também inclui várias bases-de-dados contidas em documentos regulatórios e na literatura estatística a este respeito.

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S+SeqTrial
Módulo S-PLUS para projetar, monitorar e analisar testes clinicos usando técnicas estatísticas usuais neste campo (group sequential methods)
Uma completa biblioteca de funções do S-PLUS para projeto, monitoramento e análise de "clinical trials" usando métodos sequenciais de grupo. No método clássico de amostragem fixa o tamanho da amostra é fixada antes da coleta de dados, no sequencial os dados são monitorados durante a coleta. Especialmente útil quando aquisição automática e eletronica de dados é utilizada.

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NUOPT for S-PLUS
Um módulo com o mais avançado estado-da-arte projetado para uso em uma ampla gama de aplicações incluindo otimização de portfólios, modelagem estatística robusta e não-linear.